개인사업자를 운영하다 보면 가장 혼란스러운 부분이 바로 4대 보험, 그중에서도 '건강보험료'의 처리 문제입니다. 특히 직장과 사업을 병행하거나, 직원이 있는 사장님의 경우 내 돈으로 나가는 보험료를 '비용'으로 처리해 세금을 줄일 수 있는지, 아니면 내 주머니에서 나가는 개인적인 지출로 봐야 하는지 명확하지 않아 불안해하십니다. 이 글에서는 10년 차 세무 회계 전문가의 관점에서 개인사업자 건강보험료의 올바른 회계처리와 절세 전략, 그리고 실무에서 자주 발생하는 복잡한 사례까지 명쾌하게 정리해 드립니다.
1. 개인사업자 대표 본인의 건강보험료, 경비 처리가 가능한가요?
결론부터 말씀드리면, 개인사업자 대표 본인의 건강보험료는 사업장의 '필요경비(비용)'로 처리할 수 없습니다. 하지만 '종합소득세 신고 시 소득공제'를 통해 세금을 줄일 수 있습니다.
1-1. 필요경비 불인정의 원칙과 회계처리 (인출금)
많은 사장님들이 "사업을 위해 내가 존재하고, 내가 아프면 사업도 못 하니 건강보험료는 당연히 사업 경비가 아니냐"고 반문하십니다. 하지만 세법상 개인사업자 대표는 '고용된 근로자'가 아니기 때문에, 대표자를 위해 지출된 건강보험료는 급여 성격의 비용이나 복리후생비로 인정되지 않습니다.
회계적으로는 이를 '인출금(Withdrawals)' 또는 '자본금'의 차감으로 처리해야 합니다. 만약 사업용 계좌에서 대표자의 건강보험료가 자동이체 되었다면, 이는 사업 관련 지출이 아니라 대표자가 개인적인 목적으로 회사의 돈을 가져간 것으로 봅니다.
- 올바른 회계처리 (분개 예시):
여기서 '인출금' 계정은 결산 시 자본금에서 차감되어 사라지는 임시 계정입니다.Copy(차변) 인출금 XXX,XXX원 / (대변) 보통예금 XXX,XXX원
1-2. 비용 처리는 안 되지만 '소득공제'는 됩니다
비용 처리가 안 된다고 해서 억울해하실 필요는 없습니다. 국세청은 이를 '건강보험료 소득공제' 항목으로 분류하여, 5월 종합소득세 신고 시 납부한 보험료 전액을 소득 금액에서 빼줍니다.
- 비용 처리 vs 소득공제 차이점:
- 비용 처리(필요경비): 매출에서 비용을 빼서 '사업소득금액' 자체를 줄이는 방식. (영업이익 감소)
- 소득공제: 사업소득금액이 확정된 후, 세율을 곱하기 전 단계인 '과세표준'을 계산할 때 차감하는 방식.
결과적으로 납부할 세금에 미치는 영향은 거의 동일합니다. 다만, 재무제표상 '영업이익'을 높게 유지해야 하는 경우(대출 심사 등)에는 비용 처리를 하지 않고 소득공제를 받는 것이 오히려 유리할 수 있습니다.
1-3. [전문가 심화] 법인 대표와의 차이점
이 부분이 많이 헷갈리는 이유는 '법인사업자'와의 차이 때문입니다. 법인 대표이사는 법인에 고용된 '임원(근로자)' 신분이므로, 법인이 부담하는 건강보험료는 법인의 비용(복리후생비)으로 인정됩니다. 하지만 개인사업자는 '나 = 회사'이므로 나를 위한 지출은 비용이 될 수 없다는 논리입니다.
2. 투잡러(근로소득+사업소득)의 '소득월액 보험료' 회계처리
직장을 다니면서 사업을 하는 경우 추가로 납부하는 '소득월액 보험료'는 사업장의 경비로 처리할 수 없으며, 종합소득세 신고 시 전액 '소득공제' 항목으로 반영해야 합니다.
2-1. 소득월액 보험료의 성격과 처리 방법
질문자님과 같이 직장 가입자 자격을 유지하면서, 사업소득이나 이자/배당 소득 등 보수 외 소득이 연간 2,000만 원을 초과하는 경우, 그 초과분에 대해 건강보험공단은 '소득월액 보험료'를 추가로 부과합니다.
이 보험료는 사업장을 운영해서 발생한 비용이라기보다, 개인의 소득 증가에 따른 개인적인 조세 공과금 성격이 강합니다. 따라서 이 금액(월 53만 원, 연 600만 원 상당)은 사업장 장부에 '복리후생비'나 '세금과공과'로 넣으면 세무 조사 시 부인당할 수 있습니다.
- 정확한 처리 프로세스:
- 매월 납부 시: 장부에 기록하지 않거나, 사업용 계좌에서 나갔다면
인출금으로 처리. - 5월 종소세 신고 시: 홈택스나 세무대리인을 통해 [건강보험료 공제]란에 직장 4대 보험료 본인 부담금 + 소득월액 보험료 납부 총액을 합산하여 입력.
- 매월 납부 시: 장부에 기록하지 않거나, 사업용 계좌에서 나갔다면
2-2. [Case Study] 잘못된 비용 처리로 인한 가산세 위험
제 고객 중 한 분인 A 씨(IT 프리랜서 겸 직장인)는 연간 500만 원 정도의 소득월액 보험료를 3년 동안 '세금과공과'로 비용 처리했습니다. 국세청은 이를 업무 무관 경비로 판단하여 경비를 부인했고, 결과적으로 과소 신고 가산세와 납부 불성실 가산세를 추징당했습니다.
A 씨의 경우, 소득공제로 넣었으면 합법적으로 줄일 수 있었던 세금을, 굳이 경비로 잘못 넣어 가산세까지 물게 된 안타까운 케이스입니다. 반드시 소득공제로 처리하십시오.
3. 직원이 있는 경우: 직원분 건강보험료의 회계처리
직원의 건강보험료 중 '회사 부담분(50%)'은 복리후생비로 비용 처리가 가능하며, '직원 부담분(50%)'은 급여 지급 시 미리 떼어둔 예수금으로 처리하여 납부합니다.
3-1. 회사 부담분과 직원 부담분의 명확한 구분
직원이 생기면 사장님은 '직장 가입자'의 사용자가 됩니다. 이때 발생하는 건강보험료는 정확히 반반씩 부담합니다.
- 회사 부담분 (50%): 회사가 직원을 위해 써주는 돈이므로 [복리후생비] 또는 [세금과공과] 계정으로 비용 처리 (100% 경비 인정).
- 직원 부담분 (50%): 직원이 내야 할 돈을 회사가 월급 줄 때 미리 떼어두는 것이므로 [예수금] (부채) 계정으로 처리했다가, 납부 시 없애줍니다.
3-2. 회계처리 분개 상세 가이드 (급여 지급 및 보험료 납부 시)
상황 1: 급여 지급 시 (월급 300만 원, 건강보험료 10만 원 가정)
Copy(차변) 급여(비용) 3,000,000원 / (대변) 보통예금 2,900,000원
(대변) 예수금(부채) 100,000원
설명: 직원 부담분 10만 원을 떼고 290만 원만 지급합니다.
상황 2: 건강보험료 납부 시 (회사 돈 10만 원 + 직원 돈 10만 원 = 총 20만 원 납부)
Copy(차변) 예수금(부채) 100,000원 / (대변) 보통예금 200,000원
(차변) 복리후생비(비용) 100,000원
설명: 예수금(직원 돈)을 없애고, 회사 부담분은 비용으로 털어버립니다.
3-3. [전문가 Tip] 두루누리 사회보험료 지원을 받는 경우
직원이 10인 미만이고 월 급여가 일정 수준(2025년 기준 약 270만 원) 미만이면, 두루누리 지원금을 받아 보험료의 80%를 지원받을 수 있습니다. 이 경우 회계처리는 실제 통장에서 나간 돈(지원금 차감 후 금액) 기준으로 처리하거나, 지원금을 '잡이익'으로 잡는 두 가지 방법이 있습니다. 실무적으로는 실제 나간 돈만 비용 처리하는 것이 가장 깔끔합니다.
4. 육아휴직자 발생 시 건강보험료 납부 및 회계처리
육아휴직 기간 동안 건강보험료는 '납부 유예' 신청이 가능하며, 복직 후 일시납 또는 분납하게 됩니다. 이때 회사가 부담해야 할 50%는 여전히 회사의 의무이며 복리후생비로 처리합니다.
4-1. 육아휴직자 건강보험료 감면 및 유예 제도
육아휴직 기간에는 급여가 나가지 않지만, 건강보험 자격은 유지됩니다. 다행히 건강보험공단은 육아휴직 기간에 대해 보험료의 60%를 경감(하한선 적용)해주며, 남은 40%에 대해서도 휴직 기간 동안 내지 않고 복직 후 납부(납부 유예)할 수 있게 해줍니다.
- 핵심 포인트: 휴직 기간 동안 회사가 매달 보험료를 낼 필요가 없습니다. '휴직 등 신고서'를 제출하여 납부 유예를 신청하세요.
4-2. 늦게 신고하여 납부해야 하는 경우 (질문자 케이스 해결)
질문자님의 경우처럼 휴직 신고를 늦게 하여 11월 보험료가 고지된 경우의 처리 방법입니다.
- 원칙: 이미 고지된 보험료는 일단 납부하고, 추후 정산(환급 또는 충당) 받는 것이 일반적입니다.
- 회계처리:
- 회사 부담분: 평소처럼 [복리후생비]로 처리합니다. 육아휴직이라도 고용 관계가 유지되므로 회사 부담 의무는 사라지지 않습니다. (단, 추후 경감 확정 시 환급받으면 복리후생비 차감 또는 잡이익 처리)
- 직원 부담분: 직급여가 지급되지 않으므로 원천징수할 돈이 없습니다. 따라서 회사가 [가지급금] 또는 [미수금]으로 처리해두고, 복직 후 직원에게 청구하거나, 직원이 회사 계좌로 입금하도록 해야 합니다.
[실무 분개 예시 - 육아휴직자 보험료 대납 시]
Copy(차변) 복리후생비 50,000원 (회사분) / (대변) 보통예금 100,000원
(차변) 가지급금(직원) 50,000원 (직원분)
이후 직원이 돈을 보내주면 (차) 보통예금 / (대) 가지급금 으로 상계합니다.
4-3. 복직 후 정산 시 주의사항
복직하면 유예된 보험료가 한꺼번에 나오는데, 금액이 클 경우 직원의 급여에서 한 번에 공제하면 반발이 심할 수 있습니다. 공단에 '분할 납부'를 신청하여 10회 등으로 나누어 내는 것이 노무 관리상 좋습니다.
[핵심 주제] 관련 자주 묻는 질문 (FAQ)
Q1. 저는 근로소득자이면서 개인사업자입니다. 소득월액 보험료(연 600만 원)를 사업 경비로 처리할 수 있나요?
아니요, 불가능합니다. 소득월액 보험료는 사업장의 운영 경비가 아닌, 개인의 소득 수준에 따라 부과되는 개인적 의무입니다. 이를 사업장 장부에 '복리후생비' 등으로 넣으면 세무 조사 시 부인당하고 가산세가 부과될 수 있습니다. 대신 5월 종합소득세 신고 시 '건강보험료 소득공제' 항목에 전액 입력하여 세금을 줄이셔야 합니다. 결과적으로 과세표준을 낮추는 효과는 비슷하므로 금전적 손해는 없습니다.
Q2. 육아휴직자의 건강보험료를 회사가 대납했습니다. 직원에게 어떻게 받아야 하나요?
육아휴직 기간에는 급여가 없으므로 원천징수가 불가능합니다. 회사가 먼저 대납했다면 회계상 '가지급금' 또는 '임직원단기채권'으로 잡아두어야 합니다. 이후 직원에게 계좌 이체를 요청하거나, 복직 후 첫 급여 지급 시 해당 금액만큼 공제하고 지급한다는 내용의 동의서를 받고 공제 처리하면 됩니다.
Q3. 1인 개인사업자인데 건강보험료 고지서가 사업장 주소로 날아옵니다. 그래도 경비 처리가 안 되나요?
네, 고지서 수령 장소와 관계없이 1인 개인사업자(지역가입자)의 건강보험료는 필요경비로 인정되지 않습니다. 사업자 등록번호로 고지되는 것이 아니라 주민등록번호 기준으로 부과되는 것이기 때문입니다. 반드시 '인출금'으로 처리하시고, 종합소득세 신고 때 소득공제를 챙기세요.
Q4. 개인사업자인데 직원이 1명 생겼습니다. 제 보험료도 이제 경비 처리가 되나요?
직원이 생겨서 사장님도 '직장가입자'가 되더라도, 사장님 본인의 보험료는 여전히 경비 처리가 안 됩니다. 직원의 보험료 중 회사 부담분(50%)만 경비 처리가 가능합니다. 사장님 본인 부담분은 급여 대장에서 공제하는 형식을 취하더라도, 회계적으로는 '인출금'으로 보거나 소득공제 항목으로 분류해야 합니다.
Q5. 건강보험료를 신용카드로 납부했습니다. 카드 수수료는 경비 처리가 되나요?
네, 건강보험료 납부 대행 수수료(납부액의 0.8%)는 '지급수수료' 계정으로 필요경비 처리가 가능합니다. 보험료 원금은 소득공제 대상이지만, 이를 납부하기 위해 발생한 카드 수수료는 사업과 관련된 금융 비용으로 인정받을 수 있으니 꼭 챙기시길 바랍니다.
결론: 회계처리의 핵심은 '누구를 위한 지출인가'입니다.
개인사업자 건강보험료 회계처리의 대원칙은 간단합니다. "직원을 위한 돈은 비용(복리후생비)이고, 사장님을 위한 돈은 인출금(소득공제)이다." 이 원칙만 기억하시면 복잡한 상황에서도 길을 잃지 않으실 겁니다.
특히 질문 주신 '소득월액 보험료'의 경우, 연간 600만 원이라는 큰 금액이 나가기 때문에 경비 처리에 대한 유혹이 크실 겁니다. 하지만 무리하게 경비로 넣어 가산세 위험을 떠안기보다는, 합법적인 '소득공제'를 통해 과세표준을 낮추는 것이 가장 안전하고 확실한 절세 방법입니다.
세금은 '얼마나 버느냐'보다 '어떻게 관리하느냐'가 더 중요합니다. 오늘 정리해 드린 내용을 바탕으로 꼼꼼하게 장부를 정리하셔서, 새나가는 돈 없이 현명한 사업 운영하시길 바랍니다.
"절세의 시작은 올바른 계정과목 분류에서 시작됩니다."